Aktivitas santri PPSSNH terdiri dari:
- Kegiatan pokok
- Pengajian kitab kuning
- Khitobah, diba'iyah, istighotsah dan aurod
- Kegiatan Ekstra
- Keputrian
- Jamaah shalawat Banjari
- Diskusi dan wawasan keilmuan
- Pengabdian masyarakat
- Olahraga
- Kursus Bahasa Inggris
Pengajian di PPSSNH menggunakan perpaduan sistem tradisional dan modern. Dalam segala aktivitas pembelajaran didukung program diskusi, setoran serta Madrasah Diniyah yang menggunakan sistem semester, dilengkapi dengan gedung yang cukup representatif serta beberapa unit komputer dan fasilitas pendukung lainnya.